An Education Blog

word direction logo

Исследования отложений, сухой грязи и проб воды из озера elmenteita показывают присутствие thaumarchaeota и эвриархеоты- (Russian)

Jacqueline O. Akanga, Hamadi I. Boga, Hans-Peter Klenk

Institute for Biotechnology Research, Jomo Kenyatta University of Agriculture and Technology, Nairobi, Kenya

Taita Taveta University College. Voi, Kenya

Newcastle University, School of Biology, Newcastle Upon Tyne, UK

Key words: Thaumarchaeota, Euryarchaeota, 16S rRNA, metagenomics, Lake Elmenteita.

Image: 0101565468, License: Rights managed, Pyrococcus furiosus archaea, coloured scanning electron micrograph (SEM). Archaea are single- celled organisms that are similar to bacteria, but also have characteristics of higher organisms, as well as unique characteristics. The thin strands seen here are flagella. Each organism has a group of flagella at one end of the cell that it uses for locomotion. P. furiosus is a hyperthermophile; it is only found living in near-boiling water. At temperatures below 70 degrees Celsius it freezes and dies. It lives in undersea hot vents that are also subject to great pressure and lack oxygen. Instead of oxygen, it uses sulphur for respiration. Magnification: x12,500 when printed 10 centimetres wide., Property Release: No or not aplicable, Model Release: No or not aplicable, Credit line: Profimedia.cz, Sciencephoto RM

Аннотация

Таким образом, чтобы обеспечить новое понимание разнообразия архей в сухой грязи, осадка и воды из озера Elmenteita в Кении, было проведено расследование с использованием культуры независимый подход после извлечения общего геномного ДНК из проб окружающей среды с использованием методов извлечения подходящих. Были построены небольшие вставки клонов библиотеки усилительных 16S рРНК генов с помощью архей специфические праймеры, а затем клонирования из которых были получены 94 non химерных последовательности и были определены в общей сложности 34 оперативных таксономических единиц (OTUs). OTUs были сгруппированы в Thaumarchaeota (6%) и эвриархеоты (94%). Примерно 90% клонов были связаны с генами от uncultured археи, по сравнению с 10%, что показали принадлежность генов из ранее культивировали архей. Сходство виртуализированный клонов типа штаммов был ниже, чем сходство uncultured членов архей. Клоны из воды и отложений были преобладаны последовательностей из эвриархеотам, в то время как клоны из проб сухой грязи показал принадлежность к эвриархеоты и Thaumarchaeota, с большей частью Фила, будучи эвриархеоты. Это первое исследование отчетности присутствие представителей Thaumarachaeota от озера Elmenteita и добавляет последовательности из озера Elmenteita разработки базы данных 16S рРНК клонов библиотек, полученные из источников экологических.
Get the original articles in Source: Volume 6, Number 6, June 2015 – JBES

Leave a Reply

Share this

Journals

Email Subscribers

Name
Email *