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Estudo filogenético de genes resistentes em silico- (Portuguese)

Mahsa Mohammad Jani Asrami, Hamid Najafi Zarrini

Plant Breeding Department, Sari Agricultural Sciences and Natural Resources University (SANRU), Sari, Iran

Key words: Resistance genes, Cluster analysis, Phylogenetic analysis

Resumo
pingpong2Apesar dos avanços de singnificant na planta, estratégias de controle da doença, mas também um grande número de pragas e patógenos está trazendo muitos danos. Comparando as seqüências de aminoácidos das proteínas codificadas pelos genes de resistência em plantas com diferente origem evolutiva mostrou que genes de resistência com base na semelhança estrutural com os produtos de proteína do NBS-LRR (Nucleotide binding Site-leucina ricos se repete), LRR extracelular, receptores LRR-quinase são classificados. Este estudo investigar a relação entre seqüências de proteínas do gene em várias plantas, seu intraction foi determinado software de Bioinformática. A análise de cluster de seqüência de proteínas que esses genes estão localizados em três grupos identificados. Arabidopsis thaliana planta contendo o gene de resistência RLM1 localizado em um grupo de seprate. Resultados de matriz de distância evolutiva demonstrou que a maioria dos distância (0,99) entre a planta Populus trichocarpa e Solanum lypersicum e a distância mínima (0,287) entre Solanum lypersicum e Vitis vinifera. Os resultados da proteína classificação simulado que genes de resistência são distantes e não uma origem semelhante. Gene de Rlm1 resultados funcionais em Arabidopsis thaliana revelou que este gene está localizado no cromossomo 1 e Unido com sinais intercelulares ou extracelulares na transmissão de sinais de uma membrana para outros trabalhos.

Source/In English: http://www.innspub.net/wp-content/uploads/2015/01/IJB-V6No2-p237-241.pdf

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