An Education Blog

word direction logo

Phylogenetic razmerja in silicij izraz profila PELPK1 Arabidopsis thaliana (L.) Heynh *- (Slovenian)

Abdur Rashid, Michael Deyholos

Department of Biological Sciences, University of Alberta, Edmonton, Alberta, TG6 2E9, Canada

Current address: 401C Plant Science Bldg., University of Kentucky, Lexington, KY 40546, USA

Current address: IK Barber School of Arts & Sciences, The University of British Columbia, Okanagan Campus, SCI 316, 1177 Research Road, Kelowna, Canada

Key words: Arabidopsis thaliana (L.) (Heynh.), PELPK, phylogeny, bioinformatics, expression, inducibility, in silico.

Izvleček
Arabidopsis_thaliana-zandraket02Osnovi bioinformatika in računalniške analize, Arabidopsis thaliana gena (L.) (Heynh.), At5g09530 bil prej označeni kot PELPK1 in njegove domnevne paralog, At5g09520 kot PELPK2. V tem poročilu, silico analize opravljeni so bili nadaljnji za določanje phylogenetic razmerja PELPK1 z proteomes A. thaliana (L.) (Heynh.) in druge vrste Kritosemenke; in izraz vzorec in islandski lišaj PELPK1 v rastline Arabidopsis. Podatki kažejo, da PELPK1 in PELPK2 so tesno povezane in tvorijo podskupino hidroksiprolina bogato glikoprotein (HRGP)-družina beljakovine; PELPK in podobni motivi so ohranjeni veliki evolucijskim razdaljam, ki vključujejo monocot in dicot; PELPK1 je zelo odziven na nekaterih biotski dejavniki in elicitors, zmerno odzivajo na abiotski dejavniki, ne odzivajo na skupno rastnih hormonov, in je negativno odziven naravnih fitosteroli; in da je pretežno izražena v zgodnjih in poznih fazah rasti Arabidopsis. Zgoraj v silicij podatki ustrezajo delno naše eksperimentalnih ugotovitev poročali prej.

Source/In English: http://www.innspub.net/wp-content/uploads/2015/01/IJB-V6No2-p93-99.pdf

Leave a Reply

Share this

Journals

Email Subscribers

Name
Email *